Родился 16 октября 1968 года в Москве. Вскоре его семья переехала во Владивосток. Пел в детском хоре, с которым объездил многие города страны. Окончил Дальневосточный государственный университет по специальности «востоковедение и африканистика». Некоторое время прожил в Китае, а затем в Великобритании. Осенью 1983 года была создана группа «Мумий Тролль» в составе Лагутенко, Краснов, Луценко, Бурлаков. В 1980-х она записала два альбома: «Новая луна апреля» и «Делай Ю-Ю!». Новый этап в истории группы начался в 1996 году, когда Лагутенко в Лондоне при помощи английских музыкантов записал диск «Морская». Он вышел в России в 1997-м, вскоре последовал альбом «Икра», и «Мумий Тролль» стал популярнейшей российской группой рубежа веков. В дискографии коллектива также альбомы «Шамора» (1998), «Точно Ртуть Алоэ» (2000), «Меамуры» (2002), «Похитители книг» (2004), «Слияние и Поглощение» (2005). Ныне Илья Лагутенко — лидер группы «Мумий Тролль», вокалист, гитарист, автор музыки и текстов, продюсер, президент фирмы «Утекай звукозапись». В Шанхай приезжал в 1997 году навестить родных. В мае 2005 года Илья Лагутенко в составе группы «Мумий Тролль» выступил с концертами в Шанхае и ряде других городов КНР.